故事设定在“猿类流感”病毒在全球蔓延的背景下，人类濒临灭绝，而进化出高级智能生物的猿类成为了食物链顶端的王者。时代变了，暴虐的猿族首领凯撒在废墟中建立了猿族历史上的第一个帝国——人猿星球的崛起，这是新世界秩序诞生的曙光。神秘的人类女孩诺娃的出现引起了凯撒的警觉。她似乎掌握着一个巨大的秘密，不仅影响到人类的生存，甚至可能再次颠覆整个人猿星球。诺娃被迫逃离，在躲避蒂萨军队的同时，遇到了一只年轻的猿猴诺亚的命运，开始了一段冒险的旅程。